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SARS-CoV-2スパイクタンパク質とACE2の結合親和性の生物種間比較とウイルス起源に関するインシリコ研究

タイトル SARS-CoV-2スパイクタンパク質とACE2の結合親和性の生物種間比較とウイルス起源に関するインシリコ研究
著者紹介 サクシ・ピプラニ、プニート・クマール・シン、デヴィッド・A・ウィンクラー、ニコライ・ペトロフスキー
雑誌 サイエンティフィック・レポート
日付 06/24/2021
土居 https://doi.org/10.1038/s41598-021-92388-5
はじめに SARS-コロナウイルス2(SARS-CoV-2)によるCOVID-19の大流行は、その起源とヒトへの感染メカニズムに関する重要な調査を促した。重要な研究領域は、コンパニオンアニマルや商業動物がSARS-CoV-2の媒介となりうるかどうかということであり、初期のデータでは種特異的な感受性が示されていた。種を超えたSARS-CoV-2感受性の理解を深めるために、本研究では構造相同性モデリング、蛋白質-蛋白質ドッキング、分子動力学シミュレーションを含むインシリコアプローチを採用した。その目的は、SARS-CoV-2スパイク蛋白質が、様々な関連生物種のアンジオテンシン変換酵素2(ACE2)と結合する能力を解析することであった。SARS-CoV-2スパイク蛋白質は、評価したすべての生物種の中でヒトACE2と最も強い結合力を示し、最も多くの水素結合を形成した。注目すべきは、センザンコウのACE2が比較的低い配列相同性にもかかわらず2番目に高い結合親和性を示したことであり、サルのACE2はhACE2との高い配列相同性にもかかわらずかなり低い親和性を示した。これらの観察結果は、種を超えた分析には、配列に基づく視点よりも構造的視点が有益であることを強調している。予測される結合親和性の上限の範囲内にあるACE2種(サル、ハムスター、イヌ、フェレット、ネコを含む)は、SARS-CoV-2感染に対して寛容であることが確認されており、結合親和性と感染感受性との関係を裏付けている。これらの結果は、SARS-CoV-2の最も初期の分離株は、ヒトACE2との強い結合に驚くほどよく適応しており、ヒトからヒトへの効率的な呼吸器感染に役立っていることを示している。この研究は、インシリコ構造モデリング法が、新規ウイルスに対する洞察を迅速に生み出し、その挙動を予測し、対策開発を支援する上で有用であることを示している。
引用 Piplani, S., Singh, P. K., Winkler, D. A., & Petrovsky, N. (2021).SARS-CoV-2スパイクタンパク質-ACE2結合親和性の種間におけるインシリコ比較とウイルス起源への示唆。Scientific Reports, 11(1), 13063. https://doi.org/10.1038/s41598-
産業 リサーチ&ラボラトリー , 製薬業界
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