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励起状態増幅ルテニウムポリピリジルIRプローブのDNA四重鎖結合に関する良好な振動報告

タイトル 励起状態増幅ルテニウムポリピリジルIRプローブのDNA四重鎖結合に関する良好な振動報告
著者紹介 マーク・スティッチ、ダビデ・アバリアーノ、ダニエル・グラジック、イアン・P・クラーク、レティシア・ゴンサレス、マイケル・タウリー、スーザン・J・クイン
雑誌 アメリカ化学会誌
日付 09/22/2023
土居 https://doi.org/10.1021/jacs.3c06099
はじめに 本研究では、ニトリルを用いたRu(II)ポリピリジル錯体が、G-四重鎖構造に対する高感度赤外プローブとして機能することを示した。紫外可視吸収分光法により、ヒトテロマー配列によって形成されるハイブリッドhtel(K)およびアンチパラレルhtel(Na)G4に対するエナンチオマー特異的結合が示された。400nm励起による複合体の時間分解赤外(TRIR)分光では、Λ-1/htel(K)、Δ-1/htel(K)、Λ-1/htel(Na)結合ではグアニン塩基との相互作用が支配的であることが明らかになった。逆に、Δ-1/htel(Na)結合はループのチミン塩基やアデニン塩基と相互作用する。2232cm-1のニトリル過渡振動は、DMSO/水混合溶液中では水素結合環境が減少するにつれて低周波数側に直線的にシフトし、結合ポケット内のニトリル環境のレポーターとして機能している。D2O中での複合体の寿命は、DNAの結合に伴って増加し、溶媒環境からより保護されていることを示しており、分子動力学シミュレーションと結合エネルギー計算によって裏付けられた。このことは、光活性剤の結合部位を決定するためのIRプローブの有用性と、生物学的環境の報告におけるその可能性を強調するものである。
引用 励起状態増幅ルテニウムポリピリジルIRプローブのDNA四重鎖結合に関するGood Vibrations Report。J. Am.Chem.Soc.Vol.145(39):21344-21360。DOI: 10.1021/jacs.3c06099
エレメント ルテニウム(Ru) , ナトリウム(Na) , カリウム(K)
材料 化学化合物
テーマ フォトニック&オプトエレクトロニクス材料 , バイオメディカル材料
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